Celkové řešení mikrobiologické laboratoře je odlišné od obecného laboratorního inženýrství nebo purifikačního inženýrství podle požadavků na bezpečnost a použití laboratoře.Laboratoře používané především v mikrobiologii, biomedicíně, biochemii, pokusech na zvířatech, genetické rekombinaci a biologických produktech se souhrnně označují jako laboratoře biologické bezpečnosti.Laboratoř biologické bezpečnosti se skládá z hlavní laboratorní funkční laboratoře a dalších laboratoří a pomocných funkčních místností.Laboratoře biologické bezpečnosti musí zajišťovat bezpečnost osob, bezpečnost životního prostředí, bezpečnost odpadů a vzorků, dlouhodobý a bezpečný provoz a zároveň poskytovat pohodlné a dobré pracovní prostředí pro zaměstnance laboratoře.
Mikrobiologická laboratoř má místní 100-úrovňovou bakteriální zkušebnu, plísňovou zkušebnu, patogenní zkušebnu, mycí a dezinfekční místnost, kultivační místnost pro plísně, bakteriální kultivační místnost a místnost pro identifikaci nástrojů mikroorganismů, přípravu kultivačního média místnost, místnost na uchování kmenů.
